VASP 各类计算的步骤及其批处理的shell脚本
将.xsd后缀的文件批量生成VASP输入文件并进行计算。
步骤：
- 将.xsd后缀文件导入到服务器中
- 进入.xsd文件夹中
- xsd2pos 命令，将.xsd后缀文件转化为**_POSCAR文件
- 删除文件夹中的.xsd文件
- 创建**_POSCAR前缀同名的文件夹
- 将**_POSCAR文件转移到同名文件夹中
- 将需要的INCAR文件导入到对应的文件夹
- 根据对应的精度创建KPOINTS文件（顺带会生成POTCAR文件）
- 四个输入文件齐全，提交任务计算
- 返回原目录，等待计算完成
SHELL脚本如下：
python **dir/xsd2pos.py;
Origin=$(find *_POSCAR)
for i in $@;
do
str=Counterpart_${i};
mkdir ${str};
cp $Origin "${str}/POSCAR";
cd ${str};
sed -i "6s/${1}/${i}/g" POSCAR;
cp /project/zyjiang/InputFile/INCAR_Geo INCAR;
vaspkit -task 102 -kps G -kpr 0.04;
sbatch -p pub Subvasp;
cd $OLDPWD;
done
注意：
- sbatch部分可以添加直接完成计算，也可以生成了对应文件夹后，自己手动提交任务。
- 各类计算步骤主要的INCAR文件由自己写的模版给出。
- KPOINTS文件由vaspkit 生成，也可以直接复制原本做好KPOINTS模版。
- POTCAR文件由vaspkit读取POSCAR各原子后自动生成。
- 这个脚本有各种缺点，比如不能实现多步计算的步骤，如果文件夹中有其它文件也可能出现各种错误。但是相比于手动计算，已经节省了很多的无意义的重复劳动。
